Программное обеспечение EasyTau 2
Пакет программного обеспечения EasyTau 2 представляет собой универсальное решение как для полного аппаратного контроля спектрометров FluoTime 250 и FluoTime 300, так и для интерактивного анализа и фиттинга данных. EasyTau 2 может использоваться в качестве программного обеспечения для анализа данных для пользовательских установок на основе PicoQuant TCSPC electronics. Интегрированный модуль анализа и фиттинга данных поддерживает широкий спектр приложений флуоресцентной спектроскопии, таких как стационарные спектры возбуждения и эмиссии, времена жизни флуоресценции или фосфоресценции или измерения анизотропии. EasyTau 2 объединяет и улучшает функции ранее отдельных программ FluoFit и EasyTau в одном простом в использовании пакете.
- Программное обеспечение для фиттинга / анализа данных на основе PicoQuant TCSPC electronics;
- Комбинированное программное решение для фиттинга / анализа данных и управления спектрометрами FluoTime 250 и FluoTime 300;
- "Wizard"-управляемые измерения или полный контроль в индивидуальном режиме;
- Стационарный и глобальный анализ затухания с надежным анализом ошибок;
- Удобный язык программирования для автоматизации (локальный и удаленный).
Программное обеспечение EasyTau 2 может использоваться в приложениях, где время жизни флуоресценции (люминесценции), определяемое по измерению в одной точке, является ключевым параметром, таким как:
- Флуоресценция с временным разрешением (Time-Resolved Fluorescence);
- Измерение синглетного кислорода (Singlet Oxygen);
- Время разрешенная фотолюминесценция (Time-Resolved Photoluminescence, TRPL);
- Анизотропия флуоресценции (Fluorescence Anisotropy, Polarization).
Аппаратное управление FluoTime 300 | |
---|---|
Wizards | Спектр возбуждения и эмиссии, спектр возбуждения и эмиссии с течением времени, анизотропный спектр возбуждения и эмиссии, сканирование по временной шкале интенсивности, спектры эмиссии с температурным картированием, картирование возбуждения / эмиссии, квантовый выход Затухание фосфоресценции, затухание флуоресценции, времяразрешенная анизотропия, затухание с течением времени, времяразрешенное сканирование |
Режимы работы | Вспомогательный режим с использованием «Wizard» для стандартизированных измерений Индивидуальный режим с полным контролем всех параметров оборудования Режим сценариев для автоматизации рутинных измерений Удаленное выполнение скриптов (расширение автоматизации на сторонние устройства) |
Обработка исходных данных | Арифметические операции (addition, subtraction, multiplication, division), derivation, integration, normalization, smoothing, … |
Fitting модуль | |
Модели экспоненциального затухания | До 5-го порядка |
Распределение времени жизни | Гауссовская, Лоренцева, Растянутая экспоненциальная функция (до 5 пиков) |
Анизотропия | Модель экспоненциального затухания до 3-го порядка, «tail fit» затухания анизотропии и реконволюция анизотропии |
Параметры затухания | Амплитуды, времена жизни, ширина распределения, фон |
Параметры анизотропии | G-фактор, амплитуда, фон |
Параметры реконволюции | Фон, сдвиг времени, вклад рассеянного света, частота следования импульсов |
Алгоритмы | |
Нелинейный метод наименьших квадратов / MLE | Marquardt-Levenberg, Monte Carlo, ручное изменение параметров Markvardt-Levenberg, Monte-Karlo, ruchnoye |
Исправление для конечного IRF | Итеративная реконструкция |
Тест ошибок / оценка | χ2, distribution and autocorrelation of weighted residuals |
Анализ ошибок | Bootstrap |
Глобальный анализ / фиттинг mode | Для всех фиттинг моделей, количество наборов данных ограничено только памятью |
Пользовательский интерфейс | |
Графический интерфейс пользователя | Базовый графический интерфейс Windows |
Дисплей | Линейный или логарифмический масштаб, масштабируемый |
Импорт данных | ASCII файлы или для Windows буфер обмена (HydraHarp 400, PicoHarp 300, TimeHarp 260, MultiHarp 150, NanoHarp 250) |
Формат данных | |
Число каналов | Unlimited |
Ширина канала | Unlimited |
Поддерживаемое устройство | Спектрофотометры FluoTime 250 и FluoTime 300, HydraHarp 400, PicoHarp 300, TimeHarp 260, MultiHarp 150, NanoHarp 250 и ASCII |
Операционное окружение | |
Компьютер | CPU: min. 2 GHz, RAM: min 2 GB |
Дисплей | 1024 × 768 (или лучше) |
Операционная система | Windows 8.1 или 10 |
Предохранительный модуль | USB |
Lee S., Lo, D.B., Hamilton I., Daboczi M., Nam Y.S., Lee B.R., Zhao B., Jang C.H., Friend R.H., Kim J.-S., Song M.H. Advanced Science, just accepted manuscript (2018)
Reference to: FluoTime 300, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), PicoHarp 300
Dube E., Nyokong T. Journal of Luminescence (2018)
Reference to: FluoTime 300, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series)
Stacking-induced fluorescence increase reveals allosteric interactions through DNA
Morten M.J., Lopez S.G., Steinmark I.E., Rafferty A., Magennis S.W. Nucleic Acid Research (2018)
Reference to: FluoTime 300, FluoFit
Precision and accuracy of single-molecule FRET measurements—a multi-laboratory benchmark study
Hellenkamp B., Schmid S., Doroshenko O., Opanasyuk O., Kühnemuth R., Rezaei Adariani S., Ambrose B., Aznauryan M., Barth A., Birkedal V., Bowen M.E., Chen H., Cordes T., Eilert T., Fijen C., Gebhardt C., Götz M., Gouridis G., Gratton E., Ha T., Hao P., Hanke C.A., Hartmann A., Hendrix J., Hildebrandt L.L., Hirschfeld V., Hohlbein J., Hua B., Hübner C.G., Kallis E., Kapanidis A.N., Kim J.Y., Krainer G., Lamb D.C., Lee N.K., Lemke E.A., Levesque B., Levitus M., McCann J.J., Naredi-Rainer N., Nettels D., Ngo T., Qiu R., Robb N.C., Röcker C., Sanabria H., Schlierf M., Schröder T., Schuler B., Seidel H., Streit L., Thurn J., Tinnefeld P., Tyagi S., Vandenberk N., Vera A.M., Weninger K.R., Wünsch B., Yanez-Orozco I.S., Michaelis J., Seidel C.A.M., Craggs T.D., Hugel T. Nature Methods, Vol.009, p.669-676 (2018)
Reference to: MicroTime 200, FluoTime 300, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), HydraHarp 400, LSM Upgrade Kit Related to: FRET, Single Molecule Detection
Saldías M., Manzur J., Palacios R.E., Gómez M.L., Fuente J., Günther G., Pizarro N., Vega A. Dalton Transactions, Vol.046, p.1567-1576 (2017)
Reference to: FluoTime 300
Photophysical properties of rhenium(I) complexes and photosensitized generation of singlet oxygen
Ramos L.D., da Cruz H.M., Morelli Frin K.P. Photochemical & Photobiological Sciences, Vol.016, p.459-466 (2017)
Reference to: FluoTime 300
Solid solution quantum dots with tunable dual or ultrabroadband emission for LEDs
Gugula K., Entrup M., Stegemann L., Seidel S., Pöttgen R., Strassert C.A., Bredol M. ACS Applied Materials & Interfaces, Vol.009, p.521-528 (2017)
Reference to: FluoTime 300 Related to: TRPL
FRET enhancement close to gold nanoparticles positioned in DNA origami constructs†
Aissaoui N., Moth-Poulsen K., Käll M., Johansson P., Wilhelmsson L.M., Albinsson B. Nanoscale, Vol.009, p.673-683 (2017)
Reference to: Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), FluoFit Related to: FRET
A Cd-reduced hybrid buffer layer of CdS/Zn(O,S) for environmentally friendly CIGS solar cells
Rana T.R., Kim S.Y., Kim J.H., Kim K., Yun J.H. Sustainable Energy & Fuels, Vol.001, p.1981-1990 (2017)
Reference to: FluoTime 300, MicroTime 100
Deng P., Lu L.-Q., Tan T., JJin Y., Fan X.-Z., Cao W.-C., Tian X.-K. Analytical Methods, Vol.009, p.287-293 (2017)
Reference to: FluoTime 300
Lee S., Lo, D.B., Hamilton I., Daboczi M., Nam Y.S., Lee B.R., Zhao B., Jang C.H., Friend R.H., Kim J.-S., Song M.H. Advanced Science, just accepted manuscript (2018)
Reference to: FluoTime 300, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), PicoHarp 300
Dube E., Nyokong T. Journal of Luminescence (2018)
Reference to: FluoTime 300, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series)
Stacking-induced fluorescence increase reveals allosteric interactions through DNA
Morten M.J., Lopez S.G., Steinmark I.E., Rafferty A., Magennis S.W. Nucleic Acid Research (2018)
Reference to: FluoTime 300, FluoFit
Precision and accuracy of single-molecule FRET measurements—a multi-laboratory benchmark study
Hellenkamp B., Schmid S., Doroshenko O., Opanasyuk O., Kühnemuth R., Rezaei Adariani S., Ambrose B., Aznauryan M., Barth A., Birkedal V., Bowen M.E., Chen H., Cordes T., Eilert T., Fijen C., Gebhardt C., Götz M., Gouridis G., Gratton E., Ha T., Hao P., Hanke C.A., Hartmann A., Hendrix J., Hildebrandt L.L., Hirschfeld V., Hohlbein J., Hua B., Hübner C.G., Kallis E., Kapanidis A.N., Kim J.Y., Krainer G., Lamb D.C., Lee N.K., Lemke E.A., Levesque B., Levitus M., McCann J.J., Naredi-Rainer N., Nettels D., Ngo T., Qiu R., Robb N.C., Röcker C., Sanabria H., Schlierf M., Schröder T., Schuler B., Seidel H., Streit L., Thurn J., Tinnefeld P., Tyagi S., Vandenberk N., Vera A.M., Weninger K.R., Wünsch B., Yanez-Orozco I.S., Michaelis J., Seidel C.A.M., Craggs T.D., Hugel T. Nature Methods, Vol.009, p.669-676 (2018)
Reference to: MicroTime 200, FluoTime 300, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), HydraHarp 400, LSM Upgrade Kit Related to: FRET, Single Molecule Detection
Saldías M., Manzur J., Palacios R.E., Gómez M.L., Fuente J., Günther G., Pizarro N., Vega A. Dalton Transactions, Vol.046, p.1567-1576 (2017)
Reference to: FluoTime 300
Photophysical properties of rhenium(I) complexes and photosensitized generation of singlet oxygen
Ramos L.D., da Cruz H.M., Morelli Frin K.P. Photochemical & Photobiological Sciences, Vol.016, p.459-466 (2017)
Reference to: FluoTime 300
Solid solution quantum dots with tunable dual or ultrabroadband emission for LEDs
Gugula K., Entrup M., Stegemann L., Seidel S., Pöttgen R., Strassert C.A., Bredol M. ACS Applied Materials & Interfaces, Vol.009, p.521-528 (2017)
Reference to: FluoTime 300 Related to: TRPL
FRET enhancement close to gold nanoparticles positioned in DNA origami constructs†
Aissaoui N., Moth-Poulsen K., Käll M., Johansson P., Wilhelmsson L.M., Albinsson B. Nanoscale, Vol.009, p.673-683 (2017)
Reference to: Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), FluoFit Related to: FRET
A Cd-reduced hybrid buffer layer of CdS/Zn(O,S) for environmentally friendly CIGS solar cells
Rana T.R., Kim S.Y., Kim J.H., Kim K., Yun J.H. Sustainable Energy & Fuels, Vol.001, p.1981-1990 (2017)
Reference to: FluoTime 300, MicroTime 100
Deng P., Lu L.-Q., Tan T., JJin Y., Fan X.-Z., Cao W.-C., Tian X.-K. Analytical Methods, Vol.009, p.287-293 (2017)
Reference to: FluoTime 300