Программное обеспечение Applied Photophysics
Программное обеспечение для работы со спектрами кругового дихроизма и глобального анализа.
Applied photophysics предлагают следующие программные продукты:
- Global 3 Analysis Software;
- Pro-Data Software Suite;
- Pro-K Global Analysis & Data Simulation Software;
- Pro-K II - 2nd Order Global Analysis Software.
Глобальный анализ мультиволновых кинетических данных — Что это?
Глобальный анализ является специализированным методом, используемым во многих областях науки для оценки многомерных экспериментальных данных в соответствии с одной из множества специализированных моделей. Метод мультивариантного глобального анализа был реализован Applied Photophysics в пакетах аналитического программного обеспечения Pro-K и Pro-K II.
Global 3
ПО для глобального анализа The Global 3 — это программа, оптимизированная для мультиволновых спектральных данных, измеренных как функция температуры. Как правило используется для анализа КД спектров белков, полученных при разных температурах.
Global 3 вычисляет спектральные профили и профили концентрации всех видов наравне с точками плавления и энтальпиями Вант Гоффа переходов между ними. То есть позволяет вычислять структурные и термодинамические параметры из одного эксперимента. Это интерактивная программа, которая при этом интуитивно понятна и проста в использовании. Есть удобный раздел help для получения необходимой информации о программе. В дополнение к данным КД можно использовать соответствующие спектры поглощения, отражения и флуоресценции что определения пределов фиттинга по длинам волн и границ температур.
Пакет ПО Pro-Data
Платформа для управления прибором Pro-Data позволяет полностью контролировать спектрометры Chirascan™, SX, LKS или RX2000 и все аксессуары. Программа работает на последней версии Windows™ 7, она интуитивно понятна и содержит в себе полный набор для анализа и управления прибором.
- Полный контроль над прибором, включая опции;
- Комплексный сбор данных;
- Средства отображения и анализа;
- Сбор и анализ кинетических данных;
- Пост-обработка данных;
- Простая конвертация файлов в другие форматы.
Программное обеспечение разработано для прямого контроля над параметрами эксперимента, чтобы оператор всегда чувствовал себя уверенно. Все это обеспечивается за счет наличия широкого набора шаблонов экспериментов и глубокой диагностики прибора. Графический интерфейс отражает прибор, для которого предназначено ПО, однако одинаковая логика сохраняется во всей линейке Pro-Data. Таким образом, пользователь может легко переключиться с одного прибора Applied Photophysics на другой без необходимости учиться работать с нуля.
Пакет ПО Pro-K Global Analysis & Data Simulation Software
Pro-K позволяет производить фиттинг мильтиволновых кинетических массивов данных, одновременно подгоняя каждую кинетическую модель к модели реакции. Кинетические параметры должны удовлетворять данным на всех длинах волн в любой момент времени.
- Обеспечивает более качественный фиттинг, нежели отдельный анализ на каждой длине волны;
- Открывает возможности изучения более сложных реакций;
- Включает широкий набор инструментов для просмотра данных;
- Быстро оценивает качество фиттинга;
- Позволяет производить Singular Value Decomposition (SVD) массивов данных.
Эта простая операция в один клик производит оценку количества спектрально различимых компонентов, участвующих в реакции. Изолируя компоненты, лишь увеличивающие уровень шума, Pro-K позволяет исключить их тем самым увеличивая качество данных.
Пакет ПО Pro-K II — 2nd Order Global Analysis Software
Pro-K II обладает всем функционалом Pro-K и вдобавок открывает возможность одновременного анализа массивов данных, снятых при разных условиях (как правило при разных концентрациях).
- Метод Singular value decomposition (SVD);
- Неограниченное численное интегрирование для сложных механизмов реакций;
- Мощный движок моделирования данных для подбора моделей реакций;
- Одновременный анализ данных, включая флуоресценцию и абсорбцию;
- Быстрый подбор модели равновесных реакций и протонирования;
- Комплексные средства визуализации для проверки результатов.
Эти возможности уникальны и значительно расширяют исследовательские возможность при работе со сложными реакциями на основе данных спектроскопии остановленного потока. Простейший пример — реакция второго порядка: A+B > C. Стандартные пакеты глобального анализа не могут напрямую выделить спектры А и В на основе анализа блока мультиволновых данных, поскольку они линейно зависимы. Необходимо зафиксировать спектр одного из реагентов. Однако, в случае Pro-K II коэффициент и спектр могут быть получены напрямую методом проведения реакции с двумя (или более) начальными концентрациями А и В.