[:ru]Программный комплекс Amira 3D[:en]Amira 3D[:]

Программный комплекс Amira 3D купить в Техноинфо

[:ru]

Комплексный программный продукт для биологических исследований

[:en]Комплексный программный продукт для биологических исследований[:]



[:ru]
Amira – программный комплекс для обработки изображений в биологии
Программный продукт с возможностью продвинутой 3D визуализации и анализа.
Amira® – это мощное многофункциональное 3D программное обеспечение для визуализации, обработки изображений и извлечения биомедицинской информации при использовании различных техник, таких как томография, микроскопия, магнит
Amira предлагает расширенный 3D визуализируемый рабочий цикл для широкого круга исследований, от молекулярной и ядерной биологии до нейробиологии и биоинженерии.
 
[:en]

Amira® is a powerful, multifaceted 3D software platform for visualizing, manipulating, and understanding biomedical data from tomography, microscopy, MRI, and more techniques.
With incredible speed and flexibility, Amira delivers advanced 3D imaging workflows for specialists in a broad range of research areas, from molecular and cellular biology, to neuroscience and bioengineering.

[:]

[:ru]

 

Импорт и экспорт

  • Битовые форматы, TIFF, BMP, JPEG, PNG, SGI
  • Специализированные форматы для микроскопии
  • Leica, Zeiss, BioRad, Olympus, MRC
  • Медицинские форматы изображений
  • DICOM, 3D анализ
  • Нейробиологические форматы
  • Nifti, HOC, SWC- моделирование методом конечных элементов
  • FIDAP, I-DEAS, Fluent
  • Геометрическое моделирование и система автоматизированного проектирования (CAD)
  • DXF, STL, VRML, Inventor
  • Работа с различными необработанными форматами
Обработка изображений
  • 2D и 3D фильтрация
  • Устранение искажений и корректировка по оси Z
  • Ручная / автоматическая регулировка среза
  • Совмещение изображений
  • Ручная / автоматическая сегментация
  • Создание каркасных моделей и нейронных и сосудистых сетей
  • Специализированные редакторы для сегментирования и слияния
  • Формирование поверхности
  • Формирование сетки для метода конечных элементов
  • Вычисление тензоров
  • DTI трактография
  • Мощный интерфейс с большим числом предустановленных программ для выполнения
  • Ядро программы поддерживает большое количество сторонних модулей
Визуализация
  • Интерактивная высококачественная объемная визуализация
  • Перпендикулярный и наклонный срез
  • Объемная и поверхностная визуализация
  • Изолинии и изоповерхности
  • Многоканальная визуализация
  • Наложение изображений
  • Векторная и тензорная визуализация
  • Поддержка структурированной и неструктурированной сеткой
  • Молекулярная визуализация
Анализ и измерения
  • Измерения объема площади и длины.
  • Измерение плотности (статистика серых значений)
  • Со-локализационный анализ
  • Разделение по компонентам, подсчет, и анализ формы
  • Арифметические операции с изображениями, векторные поля, и бесструктурные сетки
  • Интеграция с вычислительным процессором MATLAB®
Представление результатов
  • Формирование видео
  • Улучшенная анимация ключевых кадров и объектов
  • Активное и пассивное трехмерное отображение
  • Расширения для навигации в виртуальной реальности
  • Один или несколько дисплеев
 

 

[:en]

Process
  • 2D and 3D image filtering
  • Deconvolution and Z-drop correction
  • Interactive / automatic slice alignment
  • Image registration and morphing
  • Interactive / automatic segmentation
  • Skeletonization and tracing of neural and vascular networks
  • Dedicated editors for segmentation, tracing and fusion
  • Surface generation
  • FEM grid generation
  • Tensor computation
  • DTI tractography
  • Powerful scripting interface
  • Multicore support for many modules
Visualize
  • Interactive high-quality volume visualization
  • Orthogonal and oblique slicing
  • Volume and surface rendering
  • Isolines and isosurfaces
  • Multichannel imaging
  • Image fusion
  • Vector and tensor visualization
  • Support of structured and unstructured grids
  • Molecular visualization
Analyze and measure
  • Volume, area, and distance measurements
  • Densitometry (gray value statistics)
  • Filament network statistics
  • Co-localization analysis
  • Component separation, counting and shape analysis
  • Arithmetic operations on images, vector fields, and unstructured grids
  • Direct integration of the MATLAB® compute engine
Present
  • Video generation
  • Advanced key frame and object animation
  • Active and passive 3D stereo vision
  • Virtual reality navigation tools
  • Single and tiled screen display

[:]

[:ru]

 

Программное обеспечение Amira создано из функциональных модулей, содержащих базовый пакет и опциональных дополнительных пакетов, которые позволяют оптимизировать продукт под конкретные цели.
Опциональный пакет Neuro предлагает инструменты для экспериментов с диффузионно-тензорной томографией, включая тензорную визуализацию, направленно кодированные цветовые карты (DEC) и нейронные трактограммы. В дополнение этот пакет поддерживает перфузионный анализ мозга на MR или CT сериях данных.
Опциональный пакет Molecular добавляет расширенные инструменты для визуализации моделей молекул. Использует всю мощность графической карты компьютера и мощный редактор молекул для создания сложных визуализаций молекул.
Опциональный пакет Quantification+ предлагает высокоуровневый инструмент для получения и визуализации новой квантовой информации с 3D изображений. Эта опция использует ряд программных компонентов для выполнения автоматический сегментации, свертывания, разделения объектов, и извлечения статистической геометрической информации.
Опциональный пакет Skeletonization добавляет инструменты для реконструкции, анализа, и представления каркасных моделей нейронных и сосудистых сетей и их квантовых моделей в соответствии с такими параметрами, как длина сегмента и его диаметр. Построение каркасной модели из больших наборов изображений.
Опциональный пакет VR позволяет визуализацию ваших данных на большом составном дисплее или в системе дополненной реальности. Поддерживает устройства навигации в 3D, а так же быструю многоканальную и распределенную визуализацию.
Опциональный пакет Mesh добавляет инструменты для создания трехмерных образов конечного элемента из данных с сегментированного изображения. Высококачественная визуализация достигается при помощи использования скалярного, векторного и тензорного модулей для отображения.
Опциональный пакет Very Large Data добавляет поддержку визуализации изображений, чей объём превышает максимально допустимое значение оперативной памяти вашего компьютера, оперируя данными во внешней памяти. Расширяет использование множества стандартных модулей, таких как перпендикулярный и наклонный срез, объемная визуализация, и создание изоповерхности.
Опциональный пакет Multi-Component Analysis Option: для обработки изображений, полученных различными методами. Модули этого опционного пакета включают вычислительный поток, начиная с генерирования бинарного изображения граничного слоя, разделения объединенных элементов, заканчивая извлечением параметров формы из них.
резонансная томография.

 

[:en]

The Amira software is organized in functional modules
consisting of a base package plus optional add-on packages
that allow you to optimize to customize the product to fit
your exact needs.
The Neuro Option provides tools for Diffusion Tensor
Imaging (DTI) experiments, including tensor visualization,
directionally encoded color maps (DEC) and fiber
tractography. In addition, this option supports brain
perfusion analysis on MR or CT time series data.
The Molecular Option adds advanced tools for the
visualization of molecule models. Combines hardwareaccelerated
volume rendering with a powerful molecule
editor and specific tools for complex molecular visualization.
The Quantification+ Option delivers high-level tools for
obtaining and visualizing advanced quantitative information
on 3D images. This option offers the whole range of
software tools needed to perform automated segmentation,
convolution, object separation, and to extract statistical and
geometrical information.
The Skeletonization Option adds tools for
reconstruction, analysis, and skeletonized representation of
neural and vascular networks and their quantification with
regards to parameters such as segment length and
diameter. Supports skeletonization of very large image
stacks.
The VR Option enables the visualization of your data on
large tiled displays or in immersive Virtual Reality (VR)
environments. Supports 3D navigation devices as well as
fast multithreaded and distributed rendering.
The Mesh Option adds tools for the generation of 3D
finite element (FE) meshes from segmented image data.
High-quality visualization of simulation results using scalar,
vector, and tensor field display modules.
The Very Large Data Option adds support for the
visualization of image data that exceeds the available main
memory of your computer using efficient out-ofcore data
management. Extends the use of many standard modules
such as orthogonal and oblique slicing, volume rendering,
and isosurfacing.
The Developer Option allows you to create new custom
components for visualizing or processing data, file readers
or writers, using the C++ programming language. Includes
a development wizard for getting started quickly.
The Multi-Component Analysis Option: whenever
there is the need to analyze image stacks with numerous
similar components this option provides you with the
necessary tools. The modules of this option enable a
complete workflow, from generating the binary image by
using local thresholds, separating clustered items, up to the
extraction of shape parameters from them.

[:]