Программное обеспечение ThermoFisher Scientific Avizo 3D
Система визуализации и анализа изображений, полученных с электронных микроскопов производства FEI или совместимых.
Avizo® предоставляет широчайший набор средств визуализации и анализа изображений, полученных с электронных микроскопов производства FEI или совместимых.
С помощью программного комплекса Avizo® решаются разнообразные задачи, связанные с двумерной/трехмерной визуализацией, обработкой и анализом изображений, характеристикой материалов, анализом распределения пор, трехмерным моделированием для метода конечных элементов.
Продукт разработан специально для сканирующей электронной микроскопии, систем с ионным пучком, двулучевых систем, просвечивающей электронной микроскопии производства FEI или совместимых с ними. Avizo® поднимает процессы трехмерного моделирования и анализа на качественно новый уровень – от непосредственной визуализации и прямых измерений к новейшим инструментам обработки изображений: сегментация, выделение геометрических форм, алгоритмы измерений, создание каркасных моделей.
Захват и обработка изображений:
- Поддержка снимков любого масштаба, снятых различными устройствами:
- Сканирующая электронная микроскопия;
- Системы с ионным пучком;
- Двулучевые системы;
- Просвечивающая электронная микроскопия;
- Изображения с других приборов (рентген-томография, оптическая микроскопия, и т.д.).
- Импорт файлов разнообразных форматов:
- Расширенный MRC (.mrc, .rec, .ali) от Inspect3D™;
- Расширенный TIFF от Auto Slice & View™.
- Мастер создания трехмерных изображений:
- Полученных с помощью двулучевой системы или из проектов Auto Slice & View с последующими очисткой от артефактов, подстройкой и другими нижеперечисленными обработками;
- Масштабирование, калибровка, конвертирование и ресэмплинг;
- Устранение артефактов и подстройка изображений:
- Устранение ошибок наклона и смещения луча;
- Устранение затенения/неравномерной засветки;
- Борьба с краевыми эффектами.
- Усиление контраста, фильтрация, устранение шума:
- Деконволюция;
- Усиление резкости;
- Устранение шума;
- Размытие;
- Поиск границ.
- Съемка, слияние и корреляция изображений;
- Поддержка пакетов изображений различных слоев или снятых под различными углами, снятых с помощью различных детекторов, последовательностей кадров, обработка больших объемов данных;
- Поддержка геометрических данных: скопления точек, наборы линий, поверхности и решетки;
- Поддержка метода конечных элементов.
Визуализация:
- Интуитивный и производительный интерфейс для работы с трехмерными изображениями;
- Совершенные алгоритмы создания высококачественных трехмерных моделей;
- Поддержка слоев прямоугольной сетки, косоугольной, цилиндрической и криволинейной сеток;
- Плоское проецирование;
- Выделение контуров и поверхностей;
- Применение фильтров с предпросмотром в реальном времени, получение динамически обновляемых характеристик (кривая контраста, гистограмма, цветовая карта, выделение слоев/замкнутых поверхностей и т.д.).
Сегментация:
- Отсечка по контрасту, автоматическая сегментация и маркирование объектов;
- Области роста, контурирование, интерполяция, свертка, размытие краев;
- Обработка морфологии, выделение границ и плато;
- Обработка «рваных» и засвеченных краев;
- Восстановление трехмерной поверхности и наложение сетки;
- Создание каркасных моделей и выделение связанных массивов.
Анализ:
- Встроенные средства измерения, в т.ч. измерения числа отсчетов, длин, объемов, площадей, периметров, формы (соотношения сторон), ориентации;
- Поддержка пользовательских измерений;
- Просмотр результатов включает табличные данные и картирование;
- Автоматическое измерение отдельных особенностей, трехмерное позиционирование и вывод в таблицу;
- Автоматическая статистическая обработка, вывод распределения;
- Фильтрация объектов по выбранному критерию;
- Поиск геометрических форм, измерение и сравнение;
- Определение и измерение пористости;
- Взаимодействие с Matlab® и LabView;
- Предварительная и пост-обработка структурных и потоковых симуляций.
Вывод данных, презентации:
- Расширенные возможности создания видео;
- Редактор слайдов для создания анимации, слайд-шоу и других демонстративных материалов;
- Наложение изображений, геометрических моделей, данных измерений и численного моделирования;
- Поддержка сопроводительных подписей, легенд, гистограмм и графиков;
- Экспорт трехмерных моделей, таблиц, картинок и видео;
- Поддержка активного и пассивного вывода трехмерного изображения.
Avizo – пакет самых современных средств обработки и анализа изображений. Обладая возможностями тонкой настройки и мощнейшим функционалом «из коробки», Avizo не только самостоятельный продукт, но и прекрасное дополнение к существующим системам производства FEI.
Расширения Avizo позволяют использовать его в организациях, где требуется быстрая настройка программного обеспечения для конкретных задач дву- и трехмерной визуализации и анализа.
Дополнения / Extensions
Пользователь может расширить возможности Avizo для своих конкретных задач:
- XLab позволяет исследовать физические свойства по трехмерному изображению;
- XPand дает возможность создавать пользовательские расширения с использованием открытого фреймворка Avizo, основанного на С++;
- XScreen и Xteam для совместной работы и «расширения реальности».
Avizo поставляется со стандартным пакетом Avizo Fire и следующими модулями:
- XLVolume для работы с большими массивами данных;
- XSkeleton для создания каркасных моделей;
- XMolecular для визуализации молекул.